Настройка http-сервера Apache для Windows для работы с серверными скриптами на JScript

Да. Такое возможно. Вся существующая документация для Apache приводит пример настройки, где первой строкой серверного скрипта пишется что-то вроде:

#!/usr/bin/perl
print "Content-type: text/html\n\n";
print "Hello, World.";